知识 实验室离心振荡器配合多管适配器使用,如何提高蜜蜂病原体检测的通量?
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技术团队 · HonestBee

更新于 1 天前

实验室离心振荡器配合多管适配器使用,如何提高蜜蜂病原体检测的通量?


使用配备专用多管适配器的实验室离心振荡器,通过将 DNA 提取过程从串行任务转变为并行操作,直接提高了通量。通过同时进行机械裂解多个样品管,与单独处理相比,这种设置大大缩短了样品制备所需的时间。

多管适配器的集成提供了双重优势:它通过批量处理提高了处理速度,同时确保每个样品都经历相同的物理应力,从而标准化了 DNA 提取的质量。

提高通量的机制

同时样品处理

对通量最直接的影响是能够批量处理样品。多管适配器使实验室能够摆脱一次处理一个管子的模式。

通过一次性将一整排管子放入离心振荡器中,裂解步骤所需的总有效时间除以适配器容纳的管子数量。

标准化机械裂解

有效检测蜜蜂病原体在很大程度上依赖于有效分解样品材料。离心振荡器提供机械裂解,物理破坏样品基质以释放 DNA。

同时在多个管子上进行此操作可确保通量增加不会以牺牲提取的彻底性为代价。

提高可靠性和可重复性

均匀的物理力

除了简单的速度之外,通量还受到因错误而需要重新测试的速率的限制。多管适配器使批次中的每个样品都受到均匀的物理力

这种均匀性确保样品 A 接收与样品 B 完全相同的搅拌强度和持续时间,消除了可能掩盖病原体检测的变量。

消除手动处理变量

手动裂解本质上是不一致的;人类操作员无法为数十个连续样品复制完全相同的运动和力。

通过自动化物理运动,离心振荡器减少了手动处理中常见的DNA 提取质量的差异。

对多重 PCR 的影响

通量的最终衡量标准是可用数据。高质量、一致的 DNA 提取直接提高了多重 PCR 结果的可重复性

标准化输入(DNA 质量)可确保输出(病原体检测)真实反映样品,而不是处理不一致性的反映。

解决权衡:手动与机械

手动裂解的隐藏成本

虽然没有适配器的标准离心振荡器对于低产量似乎足够,但它引入了显著的“一致性差距”。病原体检测中的主要陷阱是手动处理引入的变异性。

没有适配器,您就用设备成本换取了更高的实验噪声风险。不一致的裂解会导致 DNA 产量可变,这可能导致下游 PCR 分析中出现假阴性,从而迫使进行昂贵的重新运行,从而破坏通量效率。

为您的目标做出正确的选择

如果您的主要关注点是可扩展性:

  • 实施多管适配器,通过将裂解转换为批量操作来最大化每小时处理的样品数量。

如果您的主要关注点是数据准确性:

  • 使用适配器消除人为处理变量,确保 PCR 结果的任何差异都归因于病原体存在,而不是提取不一致。

通过标准化施加到样品上的物理力,您可以构建一个不仅更快而且更强大的工作流程。

摘要表:

特征 手动单管处理 多管适配器处理
处理模式 串行(逐个) 并行(批量处理)
通量速度 低 - 时间随样品数量而变化 高 - 同时裂解多个管子
物理均匀性 可变 - 受操作员疲劳影响 相同 - 所有样品的力均匀
数据可靠性 实验噪声风险较高 高 - PCR 的 DNA 产量一致
劳动强度 高手动工作量 低 - 自动化搅拌

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参考文献

  1. Mariko Okamoto, Daisuke Takamatsu. A novel multiplex PCR assay to detect and distinguish between different types of <i>Paenibacillus larvae</i> and <i>Melissococcus plutonius</i>, and a survey of foulbrood pathogen contamination in Japanese honey. DOI: 10.1292/jvms.21-0629

本文还参考了以下技术资料 HonestBee 知识库 .

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